Ústav teoretické fyziky se významnou měrou podílí na přípravě doktorandů v oboru P4F1 (Teoretická fyzika, astronomie a astrofyzika). Část doktorandů tohoto oboru má své školitele na ÚTF a prof. P. Krtouš je jeho předsedou.
Ústav je garantem navazujícího magisterského studijního programu Teoretická fyzika. Velká část studentů tohoto programu má své vedoucí diplomové práce z ÚTF a též řada bakalářských prací orientovaných na teorii je vedena na ÚTF:
Díky spolupráci se zahraničními pracovišti přijíždí na ÚTF řada hostů: